Stručno vijeće je savjetodavno i stručno tijelo koje čine svi stručni radnici Centra. Ciljevi i zadaci propisani su Poslovnikom o radu Stručnog vijeća, a odnose se na unapređenje stručnog rada i razvoj kvalitete usluga koje Centar pruža.

Stručno vijeće raspravlja o stručnim pitanjima i svim područjima stručnog rada, prati realizaciju planiranih aktivnosti, predlaže mjere za unapređenje stručne prakse te organizira edukacije stručnih radnika kroz stručne teme i prikaze iskustava sa stručnih usavršavanja. 

Stručni tim djeluje sukladno Poslovniku o radu Stručnog tima Centra za rehabilitaciju Mala Terezija. Stručni tim čine socijalni radnik, psiholog, edukacijski rehabilitator, logoped, odgajatelj i medicinska sestra, a prema potrebi u njegov rad uključuju se i drugi stručni radnici. 

Stručni tim izrađuje i prati individualne programe za sve korisnike, predlaže odgovarajuće oblike  podrške, daje prijedloge i mišljenja vezana uz ostvarivanje prava korisnika te promjene oblika skrbi kako bi se svakom korisniku omogućio optimalan razvoj potencijala i ostvarivanje osobnih ciljeva. Kroz svoj rad koordinira suradnju svih stručnih radnika i daje stručna mišljenja o pitanjima važnima za kvalitetu života i podršku korisnicima. 

Komisiju za prijam i otpust korisnika čine socijalni radnici, edukacijski rehabilitator, psiholog, medicinska sestra i radni terapeut. Rad Komisije uređen je Pravilnikom o prijemu i otpustu korisnika. Komisija razmatra zahtjeve za smještaj i vodi listu čekanja.